L'Ophioglosse du Portugal est une très petite fougère annuelle caractéristique des mares temporaires acidiphiles à faible altitude. Parmi les trois espèces d'Ophioglosses de la flore française, elle se distingue par ses épis courts (en général moins de 10 paires de sporanges), ses frondes stériles étroites et sa sporulation hivernale.
Menacée par la régression des zones humides, elle est protégée dans plusieurs régions de France.