La matthiole à trois pointes est un espèce endémique du bassin méditerranéen. Elle est strictement liée aux milieux dunaires littoraux peu perturbés.
En France, cette Brassicacaea demeure fréquente en Corse, mais ne se maintient que dans quelques stations de Provence. Fortement menacée par les aménagements littoraux et la pression touristique, elle est protégée sur tout le territoire national.